MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 20269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004842	CGC	2	6	105886	105891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416452
1502	NC_004842	GGTGC	2	10	105982	105991	0 %	20 %	60 %	20 %	56416453
1503	NC_004842	G	7	7	106000	106006	0 %	0 %	100 %	0 %	56416453
1504	NC_004842	T	6	6	106093	106098	0 %	100 %	0 %	0 %	56416453
1505	NC_004842	CT	3	6	106132	106137	0 %	50 %	0 %	50 %	56416453
1506	NC_004842	TGA	2	6	106149	106154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416453
1507	NC_004842	CTT	2	6	106158	106163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416453
1508	NC_004842	A	6	6	106195	106200	100 %	0 %	0 %	0 %	56416453
1509	NC_004842	GTG	2	6	106340	106345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416453
1510	NC_004842	GCC	2	6	106350	106355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416453
1511	NC_004842	TGC	2	6	106430	106435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416453
1512	NC_004842	TCT	2	6	106511	106516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416453
1513	NC_004842	GCG	2	6	106532	106537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416453
1514	NC_004842	CAT	2	6	106538	106543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416453
1515	NC_004842	GGTTAA	2	12	106545	106556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416453
1516	NC_004842	AT	3	6	106629	106634	50 %	50 %	0 %	0 %	56416453
1517	NC_004842	TTG	2	6	106837	106842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416453
1518	NC_004842	CCT	2	6	106854	106859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416453
1519	NC_004842	GAT	2	6	106864	106869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416453
1520	NC_004842	GCC	2	6	106910	106915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416453
1521	NC_004842	CAG	2	6	106951	106956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416453
1522	NC_004842	GT	3	6	106957	106962	0 %	50 %	50 %	0 %	56416453
1523	NC_004842	AGC	2	6	106976	106981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416453
1524	NC_004842	A	6	6	107076	107081	100 %	0 %	0 %	0 %	56416453
1525	NC_004842	CAA	2	6	107136	107141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416453
1526	NC_004842	TAG	2	6	107159	107164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416453
1527	NC_004842	TGG	2	6	107166	107171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416453
1528	NC_004842	CTG	3	9	107173	107181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416453
1529	NC_004842	G	6	6	107186	107191	0 %	0 %	100 %	0 %	56416453
1530	NC_004842	TAT	2	6	107253	107258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416453
1531	NC_004842	AT	3	6	107326	107331	50 %	50 %	0 %	0 %	56416453
1532	NC_004842	GCG	2	6	107335	107340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416453
1533	NC_004842	AT	3	6	107375	107380	50 %	50 %	0 %	0 %	56416453
1534	NC_004842	TCTG	2	8	107421	107428	0 %	50 %	25 %	25 %	56416453
1535	NC_004842	ATGA	2	8	107578	107585	50 %	25 %	25 %	0 %	56416453
1536	NC_004842	TTG	2	6	107600	107605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416453
1537	NC_004842	TGG	2	6	107619	107624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416453
1538	NC_004842	ATG	2	6	107632	107637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416453
1539	NC_004842	AT	3	6	107652	107657	50 %	50 %	0 %	0 %	56416453
1540	NC_004842	GCG	2	6	107686	107691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416453
1541	NC_004842	CTA	2	6	107726	107731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416453
1542	NC_004842	GT	3	6	107780	107785	0 %	50 %	50 %	0 %	56416453
1543	NC_004842	GCG	2	6	107857	107862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416453
1544	NC_004842	GGGCA	2	10	107911	107920	20 %	0 %	60 %	20 %	56416453
1545	NC_004842	TGG	2	6	107963	107968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416453
1546	NC_004842	T	6	6	108090	108095	0 %	100 %	0 %	0 %	56416453
1547	NC_004842	GCG	2	6	108098	108103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416453
1548	NC_004842	GCA	2	6	108111	108116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416453
1549	NC_004842	G	7	7	108117	108123	0 %	0 %	100 %	0 %	56416453
1550	NC_004842	GAA	2	6	108159	108164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416453
1551	NC_004842	TTC	2	6	108187	108192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416453
1552	NC_004842	GAT	2	6	108211	108216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416453
1553	NC_004842	GAATA	2	10	108269	108278	60 %	20 %	20 %	0 %	56416453
1554	NC_004842	TGG	2	6	108357	108362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416453
1555	NC_004842	ATCT	2	8	108365	108372	25 %	50 %	0 %	25 %	56416453
1556	NC_004842	AT	4	8	108373	108380	50 %	50 %	0 %	0 %	56416453
1557	NC_004842	CT	3	6	108473	108478	0 %	50 %	0 %	50 %	56416453
1558	NC_004842	TGA	2	6	108576	108581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416453
1559	NC_004842	G	6	6	108618	108623	0 %	0 %	100 %	0 %	56416453
1560	NC_004842	CAGT	2	8	108683	108690	25 %	25 %	25 %	25 %	56416453
1561	NC_004842	CAG	2	6	108741	108746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416453
1562	NC_004842	AT	3	6	108797	108802	50 %	50 %	0 %	0 %	56416453
1563	NC_004842	GAT	2	6	108862	108867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416453
1564	NC_004842	AGC	2	6	108896	108901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416453
1565	NC_004842	GCT	2	6	108907	108912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416453
1566	NC_004842	GCC	2	6	109124	109129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416454
1567	NC_004842	TTG	2	6	109182	109187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416454
1568	NC_004842	A	6	6	109191	109196	100 %	0 %	0 %	0 %	56416454
1569	NC_004842	CTG	2	6	109212	109217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416454
1570	NC_004842	A	6	6	109243	109248	100 %	0 %	0 %	0 %	56416454
1571	NC_004842	TGGG	2	8	109284	109291	0 %	25 %	75 %	0 %	56416454
1572	NC_004842	G	6	6	109289	109294	0 %	0 %	100 %	0 %	56416454
1573	NC_004842	AT	3	6	109296	109301	50 %	50 %	0 %	0 %	56416454
1574	NC_004842	GA	3	6	109331	109336	50 %	0 %	50 %	0 %	56416454
1575	NC_004842	TAT	2	6	109428	109433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416454
1576	NC_004842	TG	4	8	109453	109460	0 %	50 %	50 %	0 %	56416454
1577	NC_004842	AGG	2	6	109472	109477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416454
1578	NC_004842	AGGGT	2	10	109500	109509	20 %	20 %	60 %	0 %	56416454
1579	NC_004842	TGC	2	6	109519	109524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416454
1580	NC_004842	CAC	2	6	109546	109551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416454
1581	NC_004842	GT	3	6	109623	109628	0 %	50 %	50 %	0 %	56416454
1582	NC_004842	AAGA	2	8	109643	109650	75 %	0 %	25 %	0 %	56416454
1583	NC_004842	GCA	3	9	109721	109729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416454
1584	NC_004842	ATA	2	6	109760	109765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416454
1585	NC_004842	TAGG	2	8	109776	109783	25 %	25 %	50 %	0 %	56416454
1586	NC_004842	AGG	2	6	109842	109847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416454
1587	NC_004842	TGAC	2	8	109853	109860	25 %	25 %	25 %	25 %	56416455
1588	NC_004842	A	6	6	109892	109897	100 %	0 %	0 %	0 %	56416455
1589	NC_004842	AT	3	6	109919	109924	50 %	50 %	0 %	0 %	56416455
1590	NC_004842	TTG	2	6	109957	109962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416455
1591	NC_004842	TTA	2	6	109980	109985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416455
1592	NC_004842	CTG	2	6	110041	110046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416455
1593	NC_004842	ACC	2	6	110134	110139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416455
1594	NC_004842	TTG	2	6	110147	110152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416455
1595	NC_004842	A	6	6	110178	110183	100 %	0 %	0 %	0 %	56416455
1596	NC_004842	AGG	2	6	110242	110247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416455
1597	NC_004842	ACA	2	6	110279	110284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416455
1598	NC_004842	TCA	2	6	110348	110353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416455
1599	NC_004842	TAA	2	6	110456	110461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416456
1600	NC_004842	TGGA	2	8	110462	110469	25 %	25 %	50 %	0 %	56416456
1601	NC_004842	TGA	2	6	110694	110699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416456
1602	NC_004842	GC	3	6	110742	110747	0 %	0 %	50 %	50 %	56416456
1603	NC_004842	TGG	2	6	110753	110758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416456
1604	NC_004842	CAA	2	6	110790	110795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416456
1605	NC_004842	ATA	2	6	110845	110850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56416456
1606	NC_004842	GCT	2	6	111115	111120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416457
1607	NC_004842	TG	3	6	111122	111127	0 %	50 %	50 %	0 %	56416457
1608	NC_004842	CGT	2	6	111178	111183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416457
1609	NC_004842	TAT	2	6	111223	111228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416457
1610	NC_004842	A	6	6	111273	111278	100 %	0 %	0 %	0 %	56416457
1611	NC_004842	GTC	2	6	111299	111304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416457
1612	NC_004842	GAT	2	6	111305	111310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416457
1613	NC_004842	CTG	3	9	111314	111322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416457
1614	NC_004842	GT	3	6	111351	111356	0 %	50 %	50 %	0 %	56416457
1615	NC_004842	GCA	2	6	111363	111368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416457
1616	NC_004842	GTTT	2	8	111384	111391	0 %	75 %	25 %	0 %	56416457
1617	NC_004842	GT	3	6	111398	111403	0 %	50 %	50 %	0 %	56416457
1618	NC_004842	CTG	2	6	111507	111512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416457
1619	NC_004842	TGT	2	6	111549	111554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416457
1620	NC_004842	GAT	2	6	111556	111561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416457
1621	NC_004842	GT	3	6	111567	111572	0 %	50 %	50 %	0 %	56416457
1622	NC_004842	CAAA	2	8	111645	111652	75 %	0 %	0 %	25 %	56416457
1623	NC_004842	CCT	2	6	111664	111669	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416457
1624	NC_004842	CAGTG	2	10	111685	111694	20 %	20 %	40 %	20 %	56416457
1625	NC_004842	T	6	6	111728	111733	0 %	100 %	0 %	0 %	56416457
1626	NC_004842	TGG	2	6	111856	111861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416457
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1749	NC_004842	TG	3	6	119939	119944	0 %	50 %	50 %	0 %	56416462
1750	NC_004842	A	6	6	119979	119984	100 %	0 %	0 %	0 %	56416462
1751	NC_004842	CCA	2	6	119987	119992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416462
1752	NC_004842	CAT	2	6	120035	120040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416462
1753	NC_004842	CTT	2	6	120066	120071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416462
1754	NC_004842	TCAT	2	8	120085	120092	25 %	50 %	0 %	25 %	56416462
1755	NC_004842	CTGC	2	8	120095	120102	0 %	25 %	25 %	50 %	56416462
1756	NC_004842	TTC	2	6	120150	120155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416462
1757	NC_004842	TAC	2	6	120237	120242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416462
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1759	NC_004842	A	6	6	120257	120262	100 %	0 %	0 %	0 %	56416462
1760	NC_004842	ACG	2	6	120271	120276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416462
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1765	NC_004842	GTT	2	6	120766	120771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416463
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1770	NC_004842	GTT	2	6	120903	120908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416463
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1781	NC_004842	CGG	2	6	121353	121358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416463
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1787	NC_004842	GCA	2	6	121579	121584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416463
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1796	NC_004842	TACC	2	8	122274	122281	25 %	25 %	0 %	50 %	56416464
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1838	NC_004842	GCCA	2	8	124474	124481	25 %	0 %	25 %	50 %	56416466
1839	NC_004842	AGG	2	6	124502	124507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416466
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1842	NC_004842	TGC	2	6	124681	124686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416467
1843	NC_004842	AAGA	2	8	124703	124710	75 %	0 %	25 %	0 %	56416467
1844	NC_004842	GAC	2	6	124820	124825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416467
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1848	NC_004842	CAT	2	6	125044	125049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416467
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1852	NC_004842	GCG	2	6	125417	125422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416468
1853	NC_004842	TAC	2	6	125424	125429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416468
1854	NC_004842	AC	4	8	125428	125435	50 %	0 %	0 %	50 %	56416468
1855	NC_004842	ATC	2	6	125518	125523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416468
1856	NC_004842	CATG	2	8	125595	125602	25 %	25 %	25 %	25 %	56416468
1857	NC_004842	AT	3	6	125680	125685	50 %	50 %	0 %	0 %	56416468
1858	NC_004842	AG	3	6	125689	125694	50 %	0 %	50 %	0 %	56416468
1859	NC_004842	CGAGC	2	10	125719	125728	20 %	0 %	40 %	40 %	56416468
1860	NC_004842	AGCA	2	8	125884	125891	50 %	0 %	25 %	25 %	56416468
1861	NC_004842	CAT	2	6	125892	125897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416468
1862	NC_004842	G	6	6	125906	125911	0 %	0 %	100 %	0 %	56416468
1863	NC_004842	GTGC	2	8	125943	125950	0 %	25 %	50 %	25 %	56416468
1864	NC_004842	CAG	2	6	126043	126048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416468
1865	NC_004842	CAAAA	2	10	126084	126093	80 %	0 %	0 %	20 %	56416468
1866	NC_004842	T	6	6	126494	126499	0 %	100 %	0 %	0 %	56416469
1867	NC_004842	TGA	2	6	126596	126601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416469
1868	NC_004842	GGT	2	6	126612	126617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416469
1869	NC_004842	GGGCG	2	10	126627	126636	0 %	0 %	80 %	20 %	56416469
1870	NC_004842	CGT	2	6	126661	126666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416469
1871	NC_004842	AG	3	6	126693	126698	50 %	0 %	50 %	0 %	56416469
1872	NC_004842	CTG	2	6	126745	126750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416469
1873	NC_004842	GGAT	2	8	126776	126783	25 %	25 %	50 %	0 %	56416469
1874	NC_004842	GTC	2	6	126853	126858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416470
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1876	NC_004842	CTG	2	6	126977	126982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416470
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1983	NC_004842	AGCA	2	8	133341	133348	50 %	0 %	25 %	25 %	56416475
1984	NC_004842	CATAA	2	10	133382	133391	60 %	20 %	0 %	20 %	56416475
1985	NC_004842	GAGT	2	8	133450	133457	25 %	25 %	50 %	0 %	56416476
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1988	NC_004842	ATGG	2	8	133916	133923	25 %	25 %	50 %	0 %	56416476
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1993	NC_004842	GA	3	6	134293	134298	50 %	0 %	50 %	0 %	56416476
1994	NC_004842	TTGCCC	2	12	134346	134357	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56416476
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1996	NC_004842	AGC	2	6	134394	134399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416476
1997	NC_004842	GCA	2	6	134433	134438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416476
1998	NC_004842	TAC	2	6	134481	134486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416476
1999	NC_004842	CTA	2	6	134493	134498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416476
2000	NC_004842	CCT	2	6	134501	134506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416476

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